Se hai compilato ed eseguito il tuo programma come root e poi cerchi di modificarlo come utente normale è... normale che tu non abbia i permessi per farlo, dato che prima di eseguire un'applicazione, Gambas salva tutte le classi ed i form.
Devi entrare nella cartella genitore di quella che contiene la cartella del tuo progetto e, da terminale, dare il comando chown -R nome_utente:nome_utente /nome_cartella_progetto. Cambi così il proprietario di tutti i file reimpostandolo a te.
Per quanto riguarda l'esecuzione di comandi come super-utente, io ti SCONSIGLIO di avviare Gambas con sudo dato che se per caso esegui un'operazione di cancellazione di file mal impostata in una console, ad esempio, brasi tutto il tuo sistema...
Meglio provare per tentativi e vedere se riesci ad operare usando i comandi SHELL o EXECUTE di Gambas.
