Se utilizzi Mint con Gnome selezionando gb.gui corrisponde a selezionare gb.gtk, il componente gb.gui infatti è uno "switcher" che permette di caricare la le librerie grafiche predefinite del DE in uso. In altre parole una applicazione Gambas che utilizza gb.gui caricherà le librerie QT se eseguita su una macchina con KDE, caricherà le librerie GTK+ se eseguita in ambiente Gnome.
Circa il problema dei controlli prova ad installare il pacchetto qt4-config e configurare le opzioni disponibili (ce ne dovrebbe essere una anche per i controlli).
Edit...
Ho provato su una Mint 10 in virtuale in effetti i pulsanti appaiono grigi qualunque colore imposti sia da IDE che da codice. Installando qt4-config, selezionando dal combo "Select GUI Style" un qualunque tema differente da Desktop Setting o GTK+ i controlli assumono il colore selezionato.
Ciao